其中在“深化改革举措”一栏中还特意提到，市政府将研究建立南水北调来水与本地水水价衔接机制，推进农业综合水价改革，充分发挥价格杠杆在节约用水、水污染防治和水环境保护中的调节作用。
治理原则；《意见》中也提到了对“三环水系”的分类治理原则。“水一环”，是通过实施水质净化工程和补充清水，实现水体循环流动。“水二环”，要实施清河至圆明园湖、长河至紫竹院湖和动物园湖等河湖连通与水质改善工程，在小月河、北土城沟、二道沟、北护城河、南护城河等河段实施水体循环工程。“水三环”，则继续推进永定河、潮白河、北运河绿色生态走廊工程建设，加快建设清河、凉水河、坝河、通惠河等水环境改善工程。
目标；《意见》提到，北京是资源型缺水特大城市，水资源短缺、水生态损害、水环境污染等问题均不同程度存在。希望经过未来3年左右努力，基本实现地表水、地下水、外调水与再生水、雨洪水联合调度，建立城乡统筹的水生态环境保护体系，解决重点河段污水直排入河及河道“脏、乱、臭”问题，重要水库、河道、湖泊水功能区水质达标率提高到60%以上。再用3至5年时间，将重要水库、河道、湖泊水功能区水质达标率提高到77%以上。